1967 yılında Artvin’in Şavşat ilçesi Meydancık köyünde dünyaya gelen Şahin, ilkokulu köyünde tamamladı. Hafızlığı din görevlisi olan babasından yapan Şahin, 1985 yılında İstanbul İmam-Hatip Lisesini, 1991’de de Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesini bitirdi.

1987-1993 yılları arasında Beyazıt Camii imamları Reisü'l-kurra Abdurrahman Gürses ve İsmail Biçer Hocalardan özel olarak tashih-i huruf ve aşere-takrib icazeti aldı. Fakülte yıllarında Fatih Camii’nde Emin Saraç Hoca’nın Tefsir, Hadis ve Fıkıh ders halkasına katıldı.

1994 yılında Marmara Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Tefsir Ana Bilim dalında Yüksek Lisansını, 2022 yılında da İstanbul Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Temel İslam Bilimlerinde Kıraat alanında “Mushafların Tetkiki Meselesi: Tetkiki Mesahif Heyeti Örneği” adlı teziyle doktorasını tamamladı.

Uluslararası Kur’an-ı Kerim yarışmalarında Suudi Arabistan, Katar, Kuveyt, Tunus, Cezayir, Malezya, Bahreyn, İran, Almanya, Hindistan, Gambiya, İtalya, Filistin, Bulgaristan, Bosna-Hersek ve Moskova’da jüri olarak ülkemizi temsil etti. İstanbul’un muhtelif camilerinde imam-hatip olarak çalıştıktan sonra, 1996-2013 yılları arasında 17 yıl İstanbul Fatih Camii İmam-Hatibi olarak görev yaptı. Cami görevinin yanında resmi ve özel olarak tashih-i huruf ve kıraat dersleri vererek talebe yetiştirdi.

18.04.2013 tarihinde DİB Başkanlık Müşaviri olarak atanan Şahin, 25.11.2013 tarihinden bu yana Mushafları İnceleme ve Kıraat Kurulu Başkanlığı görevini yürütmektedir.